Marmara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi Camii'nde öğle namazını müteakip kılınan cenaze namazının ardından, Gürdoğan'ın cenazesi memleketi Eskişehir’e gönderilerek toprağa verildi.
İstanbul'daki hastanede sabah saatlerinde vefat eden Prof. Dr. Ersin Nazif Gürdoğan için düzenlenen cenaze törenine TBMM Başkanı Numan Kurtulmuş, eski Üsküdar Belediye Başkanı Hilmi Türkmen, ailesi ve çok sayıda seveni katıldı.
Eskişehir’de ortaokul ve liseyi tamamlayan Gürdoğan, İstanbul Teknik Üniversitesi Mühendislik Fakültesi'nden mezun olduktan sonra, 1972 yılında Erzurum Atatürk Üniversitesi İşletme Fakültesi'nde akademik kariyerine başladı. 1976'da Ankara Üniversitesi Siyasal Bilgiler Fakültesi'nde İşletme Ekonomisi üzerine doktorasını tamamladı ve 1987'de Doçent, 1994'te Profesör unvanını aldı.
Prof. Dr. Gürdoğan’ın "Teknolojinin Ötesi", "Kültür ve Sanayileşme", "Hicaz'dan Endülüs'e", "Zamanı Aşan Şehirler" gibi pek çok eseri bulunuyor. En bilinen eserlerinden biri, üstün ahlakıyla tanınan Mehmet Zahid Kotku Hoca'yı anlattığı "Görünmeyen Üniversite" adlı kitabıdır. Gürdoğan, AK Parti'nin kurucu üyeleri arasında yer alıyordu.