Bu sıkıntının başlangıcı, Futbol Şube Başkanı Gökhan Şensan'ın ani vefatıyla başlamıştır.
Şensan'ın vefatının ardından, basketbol şubesini yöneten Nazım Torbaoğlu ve Şube Başkanı Tamer Ustaoğlu, Başkan İlker Ergüllü'ye ve bazı taraftarlara tepki göstererek istifa etmişlerdir. Torbaoğlu ve Ustaoğlu, 20 yıllık arkadaşları olan Şensan'a sezon başında ağır eleştirilerde bulunan taraftarlara da tepki göstermişlerdir.
Karşıyaka Spor Kulübü'nün en yüksek bütçeli şubesi olan basketbol branşı, bu sezon ana sponsorunu kaybetmesine rağmen, Torbaoğlu'nun mali destekleriyle zor da olsa ayakta kalabilmiştir. Basketbol takımı, Süper Lig ve Avrupa'da Şampiyonlar Ligi'nde iyi bir performans sergilemiştir.
Futbol şubesi ise, TFF 3'üncü Lig'de sezonun tüm liglerdeki galibiyet serisi rekorunu kırarak namağlup lider durumdadır. Voleybol şubesi de, Kadınlar 1'inci Ligi'nde 5'te 5'le zirveye çıkmıştır.
